|
Вычитающая гибридизация бактериальных геномов
 |
Евроген предлагает многоуровневый сервис, позволяющий сравнивать геномы близкородственных штаммов бактерий методом супрессионной вычитающей гибридизации (SSH, Akopyants et al. 1998, Proc Natl Acad Sci USA 95: 13108-13113) и получать образцы и библиотеки кДНК, обогащенные дифференциально распределенными генами. Вычтенные образцы используются для приготовления вычтенных библиотек ДНК и дифференциального скрининга.
|
| 
|
Результат дифференциального скрининга вычтенных бактериальных геномов.
В качестве трейсера была использована ДНК штамма ZW Staphylococcus aureus, а в качестве драйвера - ДНК близкородственного штамма 29213.
|
|
Дифференциальный скрининг пробами, приготовленными из невычтенной ДНК штаммов ZW и 29213 (A и B, соответственно), продемонстрировал, что полученная библиотека примерно на 95% состоит из дифференциальных клонов.
|
Материалы, предоставляемые Заказчиком:
-
Геномная ДНК, выделенная из штаммов бактерий
| СЕРВИС | КАТ.# |
ОПИСАНИЕ |
ЦЕНА, РУБ. | СРОК ВЫПОЛНЕНИЯ |
|---|
Цены действительны на территории Российской Федерации и не включают доставку.
* Услуга (CS022-3 – CS022-5) включают выделение плазмидной ДНК выявленных дифференциальных клонов (не более 100 для каждой библиотеки), Саузерн блот гибридизацию 5 клонов, отобранных из каждой библиотеки для подтверждения дифференциального распределения, секвенирование вставок для клонов с подтвержденным дифференциальным распределением (не более 10 клонов).
|
| Вычитающая гибридизация бактериальных геномов
|
CS022-1 |
Приготовление образцов вычтенной ДНК из геномной ДНК бактериальных штаммов (вычитание в обоих направлениях)
|
50000 |
3-4 недели |
| CS022-2 |
Вычитание в обоих направлениях и клонирование полученных образцов в вектор из коллекции компании Евроген
|
65000 |
4-6 недель |
| CS022-3 |
Приготовление вычтенных библиотек ДНК (вычитание в обоих направлениях), скрининг библиотек в 96-луночных планшетах (по одному планшету для каждого направления) для выявления дифференциально-
распределенных последовательностей* |
102500 |
5-6 недель |
| CS022-4 |
Приготовление вычтенных библиотек ДНК (вычитание в обоих направлениях), скрининг библиотек в 96-луночных планшетах (пять планшетов для одного направления и один - для другого)* |
137500 |
5-11 недель |
| CS022-5 |
Приготовление вычтенных библиотек ДНК (вычитание в обоих направлениях), скрининг библиотек в 96-луночных планшетах (по пять планшетов для каждого направления)* |
165500 |
5-11 недель |
Результат работы (передается Заказчику):
1. Вычтенные образцы ДНК и другие образцы, полученные в процессе выполнения заказа
2. Праймеры для амплификации вычтенной ДНК
3. Готовая к трансформации вычтенная ДНК, лигированная в бактериальный плазмидный вектор (кроме уровня CS022-1)
4. 96-луночные планшеты с клонами, использованными для дифференциального скрининга (кроме уровня CS022-1)
5. Очищенная плазмидная ДНК выявленных дифференциальных клонов (не менее 1,5 мкг каждого клона; не более 100 клонов из каждой библиотеки, кроме уровня CS022-1)
6. Результаты дифференциального скрининга и Саузерн блота (кроме уровня CS022-1)
7. Охарактеризованные вычтенные библиотеки ДНК (кроме уровня CS022-1)
9. Отчет о проделанной работе
Вниманию заказчика
В случае невозможности исполнения заказа, возникшей по вине заказчика (например, неверно предоставленной информации о нуклеотидной последовательности, присланных некачественных биологических материалах), произведенные услуги подлежат оплате в полном объеме.
Конфиденциальность
Евроген гарантирует сохранение конфиденциальности данных, полученных в процессе выполнения и обсуждения заказа.
|
